经过了十个世(🥇)纪(📼)，大约在198X年的某一天(🔱)，阿特姆施莱(lái )德在日本(🥈)收养(yǎng )了义(yì )女(nǚ )唐井(恰(qià )巧(💤)是(shì )天狗施莱德(dé )小禄崎(qí )的直系血缘传人)，并传授(shòu )了她(tā )有关忍者(zhě )的一切，可能(🔲)是考虑(🚉)到地(dì )球科技(🛺)的发展(zhǎn )让他(tā )即将可能(néng )回(huí )到(dào )太(tài )空，所(🥀)以他(tā )将唐井立为(💞)自己的继(📎)承人(rén )，并告诉了她自己是外星(xīng )人(💱)的(🦗)一切真相(㊗)。随后跟随(🙂)地球上其它逃亡(wáng )阿特(🌞)姆的消息(xī )(🙀)，阿特姆施(⏰)莱德(🍄)转(⛏)战(zhàn )来到了(le )美国，并且很快(💠)拥有了(🏯)纽约市长颁(🐀)发的(de )城市金钥匙(shí )，成为纽约最大的资(zī )产家(🍑)，家财(💍)万贯(🐾)，同时拥有全市(shì )最高的大厦(🤷)，并且控制(zhì )着整(zhěng )个城(💯)市的黑(🏒)势(shì )力(💿)。
　　(🤥)同一时间里施莱(🥤)德残(👵)忍的杀害(hài )(🐞)了(🍽)身(shēn )(🏃)在美国的守护者滨(bīn )户良大师(🖍)，所谓守(🚡)护者是(shì )地球上(shàng )崇拜并保(bǎo )护阿特姆流亡(wáng )者的战士(🛃)，因为滨户良(liáng )在此之前(qián )曾经几次请(🍹)求讨(🏸)伐过天狗施莱(🔮)德的五龙忍者裁判所(suǒ )帮忙打败(🖱)这(💛)名阿(ā )特(tè )姆施莱德，但(dàn )(🙅)是(🛃)裁(🛌)判(pàn )所表(🎞)示他们只关(guān )心被(🏗)封印起来的天狗，认为(wéi )这是施(shī )莱德个冒牌货(♟)，所(🦐)以没有必要(⏭)与其一(🤠)般(🐑)见识(😂)。这(zhè )一(👧)情况惹(⛱)恼(🥈)了阿特姆(🌽)施(👅)莱(🏒)德(🎇)，之后因(🔂)为朋友(yǒu )的(de )背叛，滨户良随阿(🚹)特姆流亡者们转移逃(📛)离了日本(🥈)，但终究还是在美国被杀(🎛)害了。
　　侥幸(xìng )逃脱(tuō )的(💦)滨户(hù )良的宠(🛥)物(wù )鼠(shǔ )斯普(pǔ )(🧖)林特意外的与另外四只乌(wū )龟在纽约下水道沾(🔦)染上了由阿特姆所制作的(de )变异液体，变成了接(jiē )近(jìn )人形的变异(yì )生物(wù )，也就(⤴)诞生了(💼)新(🗄)一(yī )代的(de )忍(🚰)者神龟，斯普林特开始训练(🌥)这些(🌔)乌(wū )龟们滨(bīn )(🔉)户良(liáng )留(liú )下的忍(🔷)者功夫(fū )和知识，希望有朝一(🌵)日(rì )(🏃)能(néng )为自己的主人复仇。2003年的某一天，已经(🗻)长大并初露锋(fēng )芒(máng )的忍者神龟们终于(yú )遇(🤼)到了他们的(de )宿(🚩)敌，施莱德试(shì )图(tú )拉拢神(shén )龟之一(⏭)的(🐺)李(lǐ )奥纳(🔷)多(duō )(👮)为自己服务，但是(shì )惨遭(📂)失(shī )败，露出邪恶(👄)本性(xìng )的(💁)阿特姆施(shī )(🈴)莱德与(🤥)神(🔵)龟们开始了(le )第(📐)一(yī )战(zhàn )，最后在斯(sī )普林特出手帮助下众人(rén )合力将(jiāng )其击退。过了一段日子，施莱德展(🗳)开了复仇，并(bìng )将李奥打成重(📊)伤，在(zài )朋(péng )友帮助下逃过，休(✡)养生息(xī )(🧔)后(✝)神龟(guī )们返回纽(niǔ )约与施莱德展开第二次较量，最(zuì )终施莱德被李(🔋)奥用腾古(🥖)之剑砍下脑袋，但是我们知道这只(🏽)是他的(😿)机(jī )器(qì )外(wài )壳(🔼)，而神(shén )龟(🚃)们的代价则是(shì )失去了(le )他们的(🈶)父亲:斯(🍵)普(🚒)林特的踪迹(🐷)……为了寻找(zhǎo )(♓)失踪的父(👓)亲，神龟们(men )结识了阿特姆流亡者(🧦)一(🏹)族并(🛵)且了(😾)解(🏺)了他们的历史(shǐ )，但(dàn )是就在这时，施(shī )莱德(dé )再度出现了，一番(fān )大战后(🔥)，施(shī )莱德露(🖖)出了他的真面目，眼(yǎn )(💝)见(🤕)阿特姆(mǔ )一族利用(yòng )传(🖇)送门(mén )逃离地球(⏺)，千年的(de )复仇(📣)计划毁于(yú )一旦，施莱德气急败坏的要与神龟(🈵)们同归于(😱)尽，而最终神龟们利用传(chuán )送门逃(😼)生，施莱德(🌼)则在一(yī )片爆(bào )炸声中消失(🌕)了踪迹(jì )……